大同军曾与马士英联手围剿英霍山区的流寇，临走还在蕲州斩杀张献忠，与张献忠余部已成死敌，任由孙可望占据四川必是大患——大都督府非常清楚这一点，利用秋操的机会把侯世杰的步一镇、孙守法的步二镇、铁彪的步九镇调到汉中，把合赤烈的藏区和硕特骑兵调到打箭炉，提前做好出兵的准备，但因为议院没有通过出兵决议，粮饷、军械无法保障，大军迟迟不能展开行动。
说到底，议院还是舍不得钱，以孙庭耀为首的秦商答应出这笔军费，但提出条件——四川将自流井、贡井的盐和长江航道交给他们经营，四川巡抚龙文光和秦商反复讨价还价，好不容易达成协议，这帮家伙又开始耍赖，这件事一拖再拖，众议院直到十月底才通过出兵决议。军费有了着落，总统府立刻任命杨文岳为四川统领、龙文光为布政使、孙守法为提督军务、李国英为赞画军务，各路大军即刻启程，从北面、西面夹攻四川流贼。
这时，四川已打成一片糜烂，孙可望四月初沿长江大举进攻，大败明将秦良玉、曹英等人，攻取重镇重庆、泸州，随后挥军北上直驱cd，沿途所向披靡。南京朝廷也有所动作，辗转云贵传来诏书，授命王应熊以兵部尚书衔总督川湖云贵军务，并赐尚方宝剑——朝廷只字不提援兵、粮饷，却把麻烦塞给闲赋在家的王应熊，显然对争夺四川已无信心。
流贼一路顺风打到cd，川民苦于苛政久矣，听到流贼“蠲免三年租税”的口号便争相投顺，cd在八月初失陷，蜀王及前四川巡抚陈士奇等一批宗室、高官被擒杀。
王应熊从大同赶往巴县老家，在路上接到诏书，老家伙对朝廷的信任感激涕零，决心以身报国，还没弄清楚战况如何便下令四川各地官军赶赴cd与贼决一死战。这时候哪还有多少官军呀，各地只好驱赶百姓凑数，这支乌合之众还没到cd，便被流贼打得溃不成军，王应熊无力回天，带着参将杨展、曾英等人的残部逃往顺庆。
孙可望如愿以偿夺取cd，屁股还没坐热，不料背后又钻出个马科，这家伙打着大顺的旗号攻占夔州后奔袭重庆，留守川东的流贼大将艾能奇措手不及，被打得落荒而逃，重庆告急，孙可望只好暂时放过王应熊，回过头去打马科。
马科兵少不敢硬打，发现贼军主力扑来，马上逃向汉中，途经顺庆与王应熊的残兵相遇，双方都打起坏主意——马科的队伍不足万人，但老底子是山海关边军，战力绝对不差，王应熊有心收为己用，派人劝说马科反正听从他老人家号令，以前投降李自成的事既往不咎，马科同样有心扩充队伍，眼前这支残军最好下手，转眼便打出大同联邦楚军第二镇的旗号，勒令王应熊的残兵接受改编。王应熊气得暴跳如雷，下令杨展、曾英剿贼，结果这两个宝贝不是马科的对手，三万川军一败涂地，被俘的三千人被马科强行收编。
王应熊惹不起马科，便厚着脸皮向保宁、绥定紧急求援，秦翼明、马祥麟自然要帮川人，迅速起兵增援，不过意外的是贺珍的汉中兵也突然出现——贺珍在蛮汉山武选学堂受训半年多，洗脑彻底表现优异，被授予副将上品军阶，晋升汉中府、兴安直隶州守备，这家伙自以为贴上大同军嫡系的标签，立功心切抢下大同军进川先锋的差事，昼夜行军到达顺庆。这下乱套了，贺珍与秦翼明、马祥麟都打大同的旗号，但陕西人向着陕西人，四川人向着四川人，贺珍与马科合兵一处要欺负打明军旗号的川军，秦翼明、马祥麟也与王应熊联手向马科讨公道，大敌当前，川军与秦军居然要闹内讧。不过，双方还没大打出手就被迫收场——杨文岳率领大同军主力及时赶到，川军还没作出反应就被孙守法、侯世杰两个镇包围缴械，王应熊见势不妙马上装出一副理直气壮的样子找杨文岳理论。
“老夫乃大同联邦参议官也，你杨斗望敢图谋友军，不怕参议院弹劾吗！”王应熊使劲挥舞一封公文，心里却在暗骂，你大同倒是早点出兵呀，害得老子白为那个不争气的朝廷效忠一回，好在还来得及，又抬手一指贺珍、马科怒喝，“这两个不肖之徒都有投降闯贼的前科，暗通孙贼也未可知，还不拿下查办！”
“王大嘴，你才是脚踩两条船居心叵测。”贺珍、马科立刻跳起来指着王应熊大喊。
“误会，误会，都一家人，大敌当前，还是要同心协力剿灭贼寇。”杨文岳在总统府协理政务，什么底细都知道，贺珍是总统为降将树立的榜样，今后准有前途，马科与总统有旧交，暗中早已投靠大同，相比之下王应熊反而有些不光彩——总统府确实发出公文邀请一些前朝高官进参议院，贺逢圣欣然接受，但他王大嘴始终不表态，给亲民党惹了祸还一走了之，如今打着大明的旗号却自称是联邦参议官，这算什么人呀，算了，看在四川老乡的份上，就不揭穿他了。
王应熊哼了一声，向杨文岳一伸手：“既然是一家人，我的兵也是大同军，你马上把人放了，给我粮饷、军械。”
“不行，川军不过是一帮拿锄头、棍棒的老百姓，上了战场反而误事，必须马上遣散。”孙守法冷冷地答道。
“粮食还不够我们吃呢，哪顾得到你们这帮乌合之众。”侯世杰也随声附和。
王应熊又要发怒，杨文岳朝他摆摆手，一脸为难地说道：“老大人，我也没办法呀，进川的路