留攻讹答剌城的察合台、窝阔台带领所属部队猛烈地攻击讹答剌城。但是讹答剌城太坚固了，而且现在守军众多，不易攻破。城墙下到处是死尸和鲜血。
海尔汗也弄得筋疲力尽，头脑发胀。察合台和窝阔台天天攻城，从1219年9月起，他们已经连续攻城5个月了，城里已经快断粮了，最可恨的是讹答剌城孤立无援，而且守军在天天减少，守城军民恐慌不安。
尤其海尔汗，惶惶不可终日，他明白，破城之日就是他的死期。因为成吉思汗最恨的就是他海尔汗。所以，海尔汗最怕投降献城，或者受不住而投降。
海尔汗最担心的就是他的副将哈剌察，多次力劝海尔汗弃城投降，免得城里军民受遭殃。最后竟弄得二将不和，守城遇到很大的阻力。
现在，守城情况很不妙，城里粮食已尽，二将言语不和，士兵没有信心，弄得人心惶惶。海尔汗和哈剌察守城信心都不足。
有一天晚上，哈剌察为了保全性命，率所部乘夜离城逃跑，企图溜之大吉。但是，哈剌察和他的士兵恰被成吉思汗军俘获。哈剌察一看大势已去，就带着手下投降了。
哈剌察投降后，向蒙古人了讹答剌城城防的详细信息。但是，察合台厌恶哈剌察卖主求荣的卑鄙行径，而把哈剌察杀掉了。
蒙古军从四面八方攻城，很快便攻克了外城。海尔汗带着剩下2万多士兵退守内城。双方进行了一个多月的巷战。双方都死伤严重。讹答剌城基本上被成吉思汗军占领了。
可是，海尔汗还在坚持抵抗。他的身边仅剩下两名士兵，他们登上屋顶投掷瓦块抵抗。最后，海尔汗被蒙古军活捉。
1220年3月，察合台、窝阔台的军队，把城里的百姓像绵羊一样全部赶出来，然后蒙古军一阵大肆抢劫，然后残忍地夷平讹答剌城。历史悠久的讹答剌城，从此就从地球上消失。然后，察合台和窝阔台率军赶往撒麻耳干与成吉思汗军会合。
成吉思汗听说抓住了罪魁祸首海尔汗，他下令火炉上烧开银液。他又下令带来海尔汗。
然后，命人把烧开的银液浇进海尔汗的眼睛里。海尔汗活活被烧死。按成吉思汗的话说，“这是让他看看讹答剌城是怎么毁灭的。”
海尔汗见财起意，杀人越货，招来成吉思汗的二十万大军，弄得国破山河碎。他自己和他的国家都得到祸害。
尽管攻占讹答剌城耗去几个月时间，但是总算占领了。成吉思汗很高兴，对于攻取花剌子模这个文明故国更有信心了。
听说讹答剌城被攻破，摩诃末的心情很不好。他发疯似地叫着“我们士兵的豪情哪去了你们难道忘了，你们是安拉的子孙，你们是不可战胜的。你们竟然败在骑着兔子一样马的人手下，太没面子了安拉是不会看见这个情况的。”
摩诃末决定再与成吉思汗决个高低。他继续调兵遣将，想继续抵抗。