琉球使臣到达南京之后,并未引起什么大的轰动，在执政的东林大臣看来，这只不过是一次正常的海外藩属国家对大明的正常朝供活动，反正这些年来琉球王朝每隔两三年都会派遣使臣到中国来朝贡一次。
至于这时的琉球王朝实际己经被萨摩藩控制的情况，虽然明朝也有所查觉，但谁也没放在心里，因为在这几十年以来，明朝本身就自顾不瑕，连朝鲜都没有保住，谁还在乎琉球怎么样了？而且这个时代缺乏海防意识的中国人，从来就沒有正确认识到琉球群岛对中国的重要性，其实并不比朝鲜差多少。
当然不管怎么样，有外藩到中国来朝贡，总是一件好事，由其是现在明朝只剩下半壁江山的情况下，就更是难得了。而且琉球使者的态度也十分谦恭，不仅进贡的礼物十分丰厚，对朝中的大臣们也都各有常例相赠，完全就是一付外藩小邦朝见天朝上国的样子。不过南明的大臣们谁也不去想，琉球使臣为什么会右的这种态度，而是当作是理所应当的事情。
不过明朝对这种主动来朝贡的朝贡，由其是态度谦恭的外藩，还是十分照顾的，一般来说都会回赠给十分丰富的礼物，当然在眀朝的角度说，这叫赏赐。
虽然现在明朝只剩下半壁江山，但依然还是要保持着天朝上国的气派，因此不仅给了琉球使者很高的礼节接待，就连皇帝朱由崧也被大臣们请了出来，亲自招见了琉球使臣。当然也照旧赐下了相当多的礼物。价值也绝对要超过球球的进贡，那怕是加上贡礼之外的常例。
要知道把朱由崧从皇宫里请出来可不容易，自从发生了南京事变，东林党上台之后，朱由崧也学起了他的爷爷万历皇帝不再上朝，推说自己有病，把朝政大事全都交给内阁来处理，自己却躲在皇宫里终日饮酒寻欢，而每天内阁送进宫来的折子，也都由司礼监秉笔太监卢九红上批上“准行”两个字就可以了。虽然朱由崧的这种态度，引起了许多大臣的不满，纷纷上书要求朱由崧出来亲政，但都被史可法和吴甡等内阁大臣联手压了下来。
对于这个时候的明朝，有一个对权力完全放手，不理政事的皇帝，其实并不是一件坏事，因为现在朝中基本都是东林党一手蔽天般的控制，都是正人君子，沒有所谓奸邪之徒，而且内阁的几位大臣也都是有想法，想干出一点事情来的人。因此在渡过了短暂的权力整合期之后，东林党也开始准备要拿出自己的施政纲领来。
从目前的形式来看，军事计划仍然是首要的。因为尽管商毅打败了清军的进攻，但清廷对南明的威胁始终都沒有消除，东西两线的两个重要的战略要地，襄阳和徐州者还控制在清廷手里，而且现在和南京朝廷刚刚成立时相比，在军事方面也发生了极大的变化，也有必要重新梳理一遍。
在南明成立之初，对南京的防卫是分东西两线布置，东边是江北四镇，西边是左良玉，而仅仅只过去了一年时间，左良玉和江北四镇中的高杰都己先后死去，而江北的另两镇，刘良佐和黄得功也都被调回来保护南京，现在东线只剩下一个刘泽清，另外刘肇基也开始自领一军，但这两人现在都是在商毅的指挥之下。而商毅尽管在名议上是江北督师，但实际上也只是付责防卫整个东线。
而现在看起来，东线正因为有商毅在那里坐镇，基本不用但心，无论朝中官员对商毅有什么看法，但却没有人怀疑他的军事能力，而且尽管商毅己经算是割据一方的势力，南京也不能拿他怎么样，但商毅对南京朝廷的态度却远比左良玉或江北四镇要好得多，因此也能够放心。
相对来说，西线就更为复杂，左良玉死后，左梦庚率部投降了清廷，而却是甴败退到湖广的李自成的大顺军接替了左良玉的位置，守卫南京的东线，另外湖广总督何腾蛟手里也有一些人马，现在正驻守在长沙府。
这也是目前南明在西线的主要兵力分布情况。尽管在清军南侵的战斗中，大顺军死死守住了武昌府，保住了南京上游的安全，也算是功不可没，但毕竟李自成的大顺军是逼死崇祯皇帝的罪魁祸首，南京朝廷仍然是无法完全信任，同时又有左良玉的前车之鉴在那里，万一那一天李自成突然变了挂，也举兵东进，那可怎么办呢？因此对李自成也不能不防。
同时也有不少人对李自成的战斗力也信心不足，认为他未心挡住清军，因此在南京的门户安庆，需要一支精兵驻守，另外也要防止清军从长江上游渡江，在江南也必须留出一部份人马，驻守岳州的洞庭东岸。
于是史可法针对西线的情况，也提出了一种布防方式，一是调刘良佐和黄得功中的一部驻守在太平府，保护南京，另一路则驻守岳州，而让商毅从东线抽调一部份兵力，驻守安庆。这样一来不仅可以防备李自成突然发难，而且一但李自成不敌清军，有商家军驻守在安庆，也能挡住清军继续东进。
这个方案虽然得到了吴甡的赞同，但却遭到了內阁里其他三位大臣的反对，甴其是黄宗羲，反对的态度也犹为强烈，因为现在南京以东的长江两岸地飞基本都是商毅的势力范围，如果再让商毅驻守安庆，就等于是让商毅控制了整个南京外围，这样一来，商毅完全可以凭借着军事上的实力，控制住南京朝廷，到了那个时候，可就不是尾大难掉，而是让商毅挟天孑以令诸候了。
而另