不过正如大多数受招安的盗贼一样，郑芝龙接受了明朝的招安之后，也想把郑氏一族彻底洗白，改变海盗的名声，对郑成功的教育颇为严格。因此郑成功幼时并没有像父亲那样辗转海外，而是在国內接受正统教育，十五岁升入南安县学，十九岁参加乡试，二十岁考进南京国子监，成为一名监生，并拜钱谦益为师。如果不是清军入关，也许郑成功会通也科举，走上另一条道路。正是这种经历，才造就了郑成功始终坚持中华正统的是非观念。
在隆武朝廷建立之后，郑成功随郑芝龙朝见朱聿键，颇受朱聿键赏识，亲抚其背道：“只恨朕无女可许卿家，卿当尽忠吾家，无相忘也。”下令赐他“朱”姓，并改名为“成功”，并封他为御营中军都督，仪同驸马，。虽然朱聿键的做法有一大半是为了拉陇示好于郑芝龙之意，但对郑成功来说，仍然是一种莫大的殊荣，对朱聿键自然也是感激不尽。
正是因为己经有了这些因素，才使郑成功在对淸态度上与郑芝龙完全不同。因此商毅心里也有数，这一点并没有改变,立刻下令设宴招待郑成功一行。
但酒宴摆下之后，郑成功才意外发现，居然有一半的饭菜是曰式料理，心里也不仅暗暗的吃惊，商毅这是有意而为的吗？他竟然对自己的身世了解得这么清楚吗？
现在的郑成功，只是一个无名之辈，可还不是后来著名的国姓爷，因此他的身世现在还并不为世人熟知。但商毅却知道，郑芝龙的元配妻子，也就是郑成功的母亲，叫田川松，是曰本肥前平户侯的家臣田川七左卫门松庵之女。
不过位田川七左卫门松庵，其实是一个中国人，本名叫翁翌皇，是福建泉州人，以铁匠为生，后来移居日本平户，娶日本田川氏，形同入赘，改日本名为田川七左卫门松庵，为邑主锻刀剑，而成为平户侯的家臣。因此在后世一些著作中，把郑成功的母亲田川松，写做翁氏，也是正确的。
郑成功在出生以后，一直随母亲生活在日本平户，七岁时才被郑芝龙接到中国定居。另外这位翁氏夫人其实为郑芝龙生下两个儿孑，小儿孑过继给了田川氏，取名为田川次郎七左卫门，一直生活在日本。后来成为郑成功在日本的重要贸易伙伴。
而商毅在招待郑成功的宴席上，居然排出了日式料理，既表示商毅对郑成功的重视，这也说明商毅对郑氏父子身平事迹的了解，同时也表示商毅在曰本也有相当的基础。这当然令郑成功吃惊不已。这才知道商毅能够取得今天的成就，决不是偶然的，单是这份情报工作，就可见一斑了虽然商毅一直对郑芝龙保持着友好的态度，在不违返大原则的情况下，也尽量让步，但也不希望让郑芝龙感觉自己是真的软弱可欺，借这个机会也是告戒郑芝龙，你的老底我都清楚，别以为我怕你。
郑成功心里虽然吃惊，但表面上却也不动声色，依然和商毅把酒言欢，并且在酒桌上达成互相扶持依靠，共同抗击清军的协议。