查孔毕竟是职业军人出身，虽然报仇心切，但也没有丧失理智，南京商馆在巴石河北岸，而马尼拉城在巴石河南岸，而且生理人的军队也并不是向之前想像的那样不堪一击，因此这场战斗也许会持续好几天时间，也必要在巴石河北岸设立一个临时的指挥部，来指挥战斗，还要存放军需物资，由其是火药，菲律宾的天气指不定什么时候下雨，一定要好好保存。
在巴石河以北，比农多西侧，有一座名叫德尔蒙塔的修道院，是奥古斯丁会所属的一所修道院，离南京商馆大约有十余公里左右的路程，正符合查孔的要求。而大主教也没有意见，为了消灭异教徒，修道院当然可以供给军队驻扎。另外总督大人和大主教也都需要一个舒适的休息地方。
等大军到达修道院之后,查孔和弗朗西斯科发现,在修道院里，居然有二百多名华人难民在这里避难，查孔本来就憋着一肚火，一见这些华人自然不会放过，立刻下令，将所有的华人全部都抓起来，立刻执行枪决。而弗朗西斯科则严厉的将修道院的付责人马丁内斯修士狠狠斥责了一顿，说他包庇异教徒，违背主的意愿，并命令教会的执法人员将马丁内斯抓起来，等战事结束之后，交给奥古斯丁大教堂的宗教审判所审判。
尽管华人们一再苦苦挨求，而且不少人都拿出了佩带的十字架，声明自己是虔诚的天主教徒，但总督和大主教都不为所动，依就将修道院里二百二十七名华人全部杀害。而且大主教还义正词严的对华人表示，他们死了以后，灵魂可以得到升华，下辈子就将成为一个真正的天主教徒了。
解决了修道院里的事情之后，查孔也觉得气出了一点，因此这才下令，命待从兵在修道院驻守，并且付责运送物资，自己和大主教带领着大军，向南京商馆发动进攻。
人马大约走了半个多小时，来到了南京商馆的正北面。
其实马尼拉城里的大军一出来，就被瞭望塔上的士兵发现，只是没想到西班牙军绕了很大一个圈，才杀到商馆这边来。不过这时中华军士兵也做好了充份的准备。由两个连防守正北面，东西两面各设了一个连防守，各种武器也都架在院墙上。
本来刚到商馆的时侯，中华军就沿着院墙外侧挖了一道战壕，但沒想到这一场大雨，战壕里都集满了雨水，根本就不能再使用，不过到是可以当防城河使，这一番努力到也没有白废。同时也对围墙加强了保护，在围墙的内外围，都用泥砂袋堆原了三尺多的一圈，现在整个围墙的厚度己经超也了两米，就是用重型火炮来轰击，也能够坚持一阵子。
查孔看了看商馆的防守布置，立刻命令阿诺基三世，让他下令邦班牙土著兵，率先向商馆发动进攻，当然也是为了试探一下中华军的防守力度。当然他也不忘给阿诺基三世作出承诺，攻下商馆之后，商馆里的财物将分一半给邦班牙部落。
尽管南京商馆在马尼拉设立了还不到一年时间，但创造出的财畗去十分惊人，阿诺基三世当然知道，在商馆里面堆积的可全是好货，如果能分到一半商馆财物，可是一笔极大的收入，不禁可以购买大量的奢华物品，同时还能向西班牙人购买一批火枪。
因为得到西班牙人的支助,阿诺基三世购买到二百支火枪,组建了一支火枪队,作为自己的亲卫队,虽然西班牙人卖给他的,都是老式淘汰的火绳枪,但在土著的战斗中却是很有杀伤力的武器,如果能扩大亲卫队的规模,以后在对他加禄人、伊洛戈人的战争中,也将大占优势,甚致有可能将他加禄人和伊洛戈人都并入邦班牙部落里来,真正实行吕宋岛的土著大统一。
因此阿诺基三世立刻下令，命令五百名邦班牙士兵，向商馆发动进攻。
但就在邦班牙兵冲到离商馆一百米以内的时候，枪声响起，不少的邦班牙士兵都被打倒在地，而阿诺基三世在阵后亲自拔刀督战，催促着士兵继续向前推进。
等邦班牙兵前进到距离商馆只有五六十米的时候，大约还有四百多人，但这时枪声猛然密集起来，孑弹如同冰雹雨点一样，向邦班牙士兵拔洒了过去，从先前猛烈了一倍不止，而邦班牙士兵伤亡的人数也大大増加，被压制在距离商馆约五十米左右的地方，几乎一步都前进不了，尸体也密集得堆倒在这里，形成了一条生死线。
中华军的打击倏然加强，也让查孔大为震惊，以他的经验来判断，这致少需要千人左右的兵力，排成四段或五段连射的阵形，才能够形成这么猛烈的火力，生理人的军队会有这么多人吗？或者说生理人一直都在隐藏着自己的实力呢？
其实商馆里的守军横竖也就八百多人，而且守卫北面的只有两个连，四百多人，但却装配兵工厂生产出来的最新连发枪，包括六管、九管、十二转轮单管连发枪各十架，单管斗方填弹连发枪二十五架，多管填弹连发枪五架，共计有六十架连发枪，分成两批，轮流向敌军开火。
因为连发枪的射程比燧发枪要近，因此只能在敌军靠近到五六十米的地方，才能开火射击，但三十架连发枪一起开火，威力也十分惊人，在这样猛烈的火力打击面前，邦班牙士兵的进攻速度被瓦解，马上就退了下来，但进攻之前的五百名士兵，这时只剩下二百多人。
这下不用说是查孔和阿诺基三世，就连大主教弗郎西斯科也有些傻了眼，虽然大主教不