之后，团藏埋葬了大和的那些实验体同伴，足足有59个坟墓。团藏感叹，“1/60，为了培养出木遁忍者，其他59个孩子失去了性命。甲，你要珍惜自己的生命！”大和大声答应。那个墓区长出了幼小的树苗，大和泪流满面，“我去了，大家！我会成为木叶的根。”
后来，大和加入了根部的训练，在那里他初步认识了山中风等人。大和逐渐能够熟练使用水遁等忍术，团藏很满意，“你对查克拉的掌控变得娴熟了。”看到时机成熟了，团藏决定亲自训练大和。听到团藏要亲自指导大和，其他根部忍者都吃惊非小，各个都露出羡慕神色。
团藏带着大和来到那个墓区附近，团藏道，“我曾亲眼看到过初代火影的战斗……树界降诞、花树海降临……每一种都是强力的木遁忍术，继承他细胞的你，也应该能办得到。必须同时使用土遁和水遁性质的变化……”按照团藏的指点，大和结印，发动木遁忍术，大地钻出三根弯曲的树枝，摇摇晃晃。团藏露出失望神色，“还是不行吗？”大和道歉，“对不起，团藏大人。”
团藏道，“没办法，你毕竟不是初代大人的完整复制体。”团藏取成一个蓝紫色卷轴递给大和，“这是柱间大人留下的木遁忍术书，里面都是我用不了的忍术。但换成是你，应该能学会。”大和接过来，“我来学习团藏大人不会的忍术吗？”团藏道，“忍者世界的力量分为很多种，无法只靠一种力量来抗衡。必须融合多种力量，再依靠这力量设法统一混乱的忍者世界。我很期待你的木遁忍术！”大和郑重点头，对团藏佩服得五体投地。
——————大和的回忆结束——————————
卡卡西的声音打断了大和的思绪，“甲、甲……喂，甲！”大和问怎么了，卡卡西没好气，“走了！”两人开始检查下一个实验室，来到门前，照例卡卡西上前开门，“这里上锁了呢！”大和道，“让我来！”大和结印，把手指伸入钥匙孔中，木遁钥匙形成了，打开了那道门。卡卡西叹服，“这个木叶村失传多年的忍术，你是从哪里学到的呢？”大和说保密。
两人进入实验室，卡卡西道，“木遁忍术而言，对木叶村有着特殊的意义。这你明白吗？”大和说不清楚。两人翻看这个房间的实验册子，卡卡西道，“木叶有九尾人柱力，木遁术是能控制九尾的力量之一。”大和道，“我知道另一种力量是写轮眼。”卡卡西道，“你的木遁术不只对根，甚至对整个木叶村都大有益处。我知道团藏大人想把你留在身边，但照理来说，你更应该成为火影直系。你要不要离开根，去能够照耀到阳光的地方呢？”大和没有答话。
两人向下一个房间走去，这个房间有两个大型的玻璃器皿，器皿的表面是模糊的玻璃，不知道里面是什么。卡卡西上前查看，“这是什么？”卡卡西擦拭玻璃，玻璃变亮了，刚好反射出大和手持苦无冲过来的图像。卡卡西急忙侧身闪避，苦无划伤了卡卡西的肩膀。卡卡西稳住身形，“你干什么，甲？”大和并不答话，继续用苦无攻击。卡卡西拔出苦无，磕飞了大和的苦无。
随后，两人拔出背后的短刀，短兵相接，激烈地战斗在一起。卡卡西怒道，“你是认真的吗？”趁着卡卡西手臂受伤，大和挥刀击飞卡卡西的短刀，“是认真的！”卡卡西急退，大和紧追而上，并发出了木遁忍术，木柱击飞了卡卡西。卡卡西落在地上，打开了写轮眼。大和吃惊，急忙用手遮蔽自己的眼睛，防止写轮眼幻术。两人都是精英，互相忌惮对方的忍术，各自闪避到暗处，准备下一步的厮杀。
大和躲在器皿后，“占上风的是我，接下来……”卡卡西躲在另外一个地方，“那家伙知道对付写轮眼的方法，从一开始就痛下杀手。”卡卡西用急救包处理好肩臂伤口，“甲，既然你真打算杀我，那我也会动真格的。我们这是自相残杀啊！我是认真的……”根据声音，大和找到了卡卡西的位置，突然发动木遁忍术，用木条将卡卡西束缚在柱子上。大和举起长刀刺向卡卡西，“我真的是来杀你的！”
大和的刀子刺入了卡卡西的身体，卡卡西消失了，是影分身。一排手里剑射过来，准确击中了大和的左臂。卡卡西从后面出现，苦无贴住大和的脖子，“到此为止了！为什么杀我？”大和道，“这是任务！”卡卡西怒道，“哪有任务会要求杀死同伴的呢？”大和道，“这话真奇怪，杀死了同伴的卡卡西居然这么问！”趁着卡卡西愣神的功夫，大和完成了木分身替换，本体逃了出去。
卡卡西急忙舍弃木分身，回身格挡。大和的刀子砍下来，被卡卡西的苦无架住。两人激战两合，卡卡西后退到大型玻璃器皿前，“木遁分身吗？身手比3年前好了不少。”大和道，“所以你也动真格的吧！”卡卡西道，“我不会对同伴下手。”大和烦躁，“你不用客气！”卡卡西劝大和放弃任务，大和拒绝，拿刀上前攻击，卡卡西只好奋力招架。大和道，“对忍者而言，任务是绝对的！”
激斗中，大和再次突发木遁，用木柱顶飞卡卡西。卡卡西后退时，顺手甩出苦无，击伤了大和的大腿。卡卡西跌倒在地，大和腿部受伤，也只好先躲到暗处。卡卡西道，“任务不是绝对的，如果杀死同伴是你的任务，这说明任务本身就是错的。命令你执行这个任务的人