同时，时空管理局派驻魔禁世界的监察者奥莱尔斯在获得梅伊比斯授权的情况下插手，右方之火的计划败露，第三次世界大战戛然而止。随后罗马正教教皇马钉利斯重新掌权，在学园都市、罗马正教、英国清教、俄罗斯成教四方联合下，右方之火的计划受到前所未有的阻力。
10月30ri，第三次世界大战终战ri。上条当麻潜入巨大要塞“伯利恒之星”，在“伯利恒计划”的最后阶段，上条当麻的右手被右方之火砍断，右方之火完成“第三只手”——「神圣右方」。但上条当麻诡异的再度长出右臂，伴随人心的善念战胜恶念，「神圣右方」迅速失去力量，并被上条当麻破坏。
战斗结束后，上条当麻将救生舱让渡给右方之火，但因他曾窥见了在“幻想杀手”中隐含的“某种东西”，并导致了亚雷斯塔的计划不得不“绕远路”。远在学园都市的亚雷斯塔恼怒之余，通过量子纠缠态以虚拟的形式出现在俄罗斯，并以一招砍下右方之火的右手「神圣右方」。
失去右手的右方之火变成了普通人，被赶来的奥莱尔斯和席薇亚回收。
11月5ri，第三次世界大战休整基本完成。罗马正教进行整编，教皇马钉利斯宣布退位，枢机主教彼得·尤古迪斯接任教皇之位。
同ri，失踪的上条当麻奇迹般回归学园都市。
由于奥帝努斯已经前往时空管理局赴任，所以原本应该发生在11月13ri的事情并没有发生。
在原著中，那一ri，在已经被压制的巴格吉城，奥帝努斯在其属下「格雷姆林」的魔法师玛丽安·丝琳格奈娅被击破之际出现，顺便捏断了上条当麻的右手并粉碎了寄宿在其体内的“看不见的存在”，并回收了玛丽安。而上条当麻则应该被奥莱尔斯和右方之火回收，并接上右臂，送回学园都市。
……
……
“亚雷斯塔的算计最终还是出现了一个大漏洞。”在「特别调查课」的院子里，梅伊比斯摇着头说道。
……
英国清教那边，实际控制者萝拉·斯图亚特，优雅地喝着红茶，脸上带着淡淡的微笑。“亚雷斯塔，终归还是露出破绽了。”
第三次世界大战终战ri那天，短暂现身俄罗斯雪原并一招击败了右方之火的人正是亚雷斯塔，此讯息自然被英国清教方面收集到了。而伴随着第三次世界大战后，学园都市、罗马正教、俄罗斯成教均已元气大伤，英国清教虽然也不能幸免，但是就最高的战力而言，随着奥莱尔斯和奥帝努斯的退出，唯有亚雷斯塔的学园都市以及萝拉的英国清教还有一决高下的资格。
通过对影像资料的分析，清教方面判定出了亚雷斯塔就是那个本应已死于1947年12月1ri英国清教刺客之手的邪恶的魔法师。
对于这个消息，萝拉脸上并无任何惊讶的表情。
“接下来出于魔法侧的大义，该是讨伐亚雷斯塔的时候了。通过宗教审判，将学园都市和科学阵营完全收入囊中，似乎也不是不可能。”
但是想到学园都市还有一个梅伊比斯存在，她又不由摇了摇头，“真是伤脑筋啊……”
……
……
—魔禁篇终—