蒙古的西下及其对新疆和中亚地区的统治，使各民族之间有了更广泛、更密切的接触，从而产生了民族间的同化、融合，导致了一些新民族的形成。回族、哈萨克族、乌孜别克族，以及近代维吾尔族的形成，都与蒙古族在新疆和中亚地区的活动有密切关系。蒙古的统治将各民族熔铸于一炉，客观上对加强各民族间的经济、文化交流，为进一步发展经济、文化创造了条件。
辛亥革命前后新疆各族人民的反帝爱国斗争，19世纪末至20世纪初，帝国主义进一步扩大对新疆的侵略，涉及到政治、经济、军事、文化等各个领域。新疆各族人民的反帝爱国斗争从未停息过，南疆策勒村人民的抗俄斗争就是最典型的例子。
居住在南疆策勒村(当时属于阗县)的沙俄商人色依提阿吉一贯欺压人民，1912年6月16日，又因霸占水利、毒打群众，激起民愤。村民在苏朴尔格带领下与之斗争。6月24日，喀什参将熊高升奉命去处置，色依提阿吉竟然指使人开枪打死熊的部下及其群众多人。策勒村人民愤怒了，他们奋起反击，烧其住宅，击毙沙俄侵略者及其爪牙数十人，色依提阿吉仓皇出逃。这就是震惊中外的“策勒村事件”。尽管袁世凯政府屈服于沙俄的淫威，屈辱地处理了这一事件，但策勒村人民的反帝爱国精神却永远载入了史册。
在反侵略斗争中，涌现出了许多杰出人物。如：塔吉克族英雄库尔察克为保卫家园，在与浩罕入侵者的战斗中壮烈牺牲；哈萨克族抗俄英雄塔扎别克率部回归祖国，与沙俄侵略者进行了殊死搏斗；藏传佛教活佛棍噶扎拉参在阿勒泰大义凛然，愤怒谴责沙俄入侵者；南疆维吾尔族村民苏朴尔格等，在策勒村事件中勇斗沙俄侵略者及其走狗，不屈不挠。他们的英雄事迹，永远激励着新疆各族人民。
由于阿古柏入侵新疆，造成了我国西北边疆的严重危机。沙俄乘机而入，出兵强占我国伊犁，并将其势力向新疆各地浸透，使危机急剧加深。伊犁各族人民不甘屈服，与侵略者进行了殊死搏斗。他们坚持抵抗了50多个日日夜夜，为保卫祖国的领土主权流血牺牲，付出了沉重的代价。
伊犁是新疆最富饶的地区之一。山河壮丽，资源富足，有优美的草场发展牧业，有肥沃的土壤、充足的水资源，宜于农业。1884年新疆建省之前，伊犁是新疆的政治、经济中心，伊犁将军统辖全疆。