趁着人群还处于兴奋状态，秦川也不跟队正们商量了，开始了他早就暗自蓄谋的整军了，反正现在距离天亮还有好几个时辰，倭兵的短脚板爬山再快，也不可能飞得过来。
这次总共缴获了一百二十余杆铁炮和一百多套倭军的足轻具足，包括战败倭军遗落的和车上崭新的，还有一百多把长短不一的倭刀和其它的武器。秦川就借着分配武器机会，把队伍重新整编了一下。
首先，他在每个小队中新设立了队副，平时负责粮草补给的分配和士兵的功勋核对，战时负责监督队正和士兵的作战，但没有指挥权。而队正平时负责队伍的训练，战时负责作战指挥。原来的队正统统保留，另提拔此次作战勇敢的几名士兵担任队副，他的亲兵老朴和梁桂两人也分下去当了队副。
现在，一队队正金永成，队副姜大（姜氏猎户兄弟的老大）；二队队正曹善，队副梁桂；三队队正李根来，队副张蒿（他在这次战斗中斩杀了三名倭兵）；四队队正韩圭，队副宋成正（斩杀了两名倭兵）；后队队正崔成焕，队副老朴。
秦川给队正和队副每人都配了一套倭军的具足和一把倭刀，但这些人都不愿意戴倭兵的阵笠，还是戴着高丽兵的那种纯粹装饰用的小头盔，同时还把高丽军服上的号衣，弄下来罩在倭军的具足上。结果全军那些分配有盔甲的兵士，通通都学着他们这幅不伦不类的打扮，让秦川有点郁闷，不过也没法，谁叫高丽人都有着高高的发髻，不像倭兵那样剃的是阴阳头，自然没法戴倭兵的阵笠。不过秦川还是让所有配有具足的军士都把阵笠背在了背上，至少可以当洗脸洗手或是吃饭用的木盆，他是想着以后把他们的高发髻统统给剃了，既清爽又方便头部救护。
至于秦川自己，倒没有这个麻烦，他本来就是个短毛的秃头，平时靠帽子遮掩，现在正好把稻田的武士头盔戴上，当然也把稻田的武士具足穿起了，还挂起了稻田的两把刀，活脱脱一个倭国武士样，就差没背上背旗了。另外，稻田的战马也被秦川征用了。
现在的稻田利吉，只能穿着武士服，赤手空拳跟在秦川屁股后面转悠，小顺和姜二（姜氏猎户兄弟的老二，被秦川放在身边当保镖了）则时刻盯防着这稻田，同时也保护他不被那些以为他是战俘（其实他就是战俘）的高丽人伤害。
原来划分的四个作战小队，秦川都没动，只是把每个小队又都分成长矛组、火枪组和选锋组，每组选一个组长。长矛组十人，负责扎住阵脚，抵挡敌人突击，特别是骑兵的突击；火枪组二十人，作为主要杀伤力的输出兵种；剩下的十来人都作为选锋组，负责近距离肉搏。另外，每个小队还配有一个传令兵、一个执旗手（不过现在无旗可执）和两个伙夫，同时每队还配有四匹骡马驮载辎重。
后队也分了二十杆火枪，组建了护卫组，被解救出来的一百多朝鲜民夫，四个队正只挑了很少的一些人来补充这次战斗中的人员损失，剩余的大部分都看不上，全塞进后队来了，结果后勤队成了人数最多的小队。现在后队不再负责做饭了（各战队自己做饭去），主要负责搭建营寨、运输物质和救护伤兵，由于队中人员除了百姓就是衙役，年龄还参差不齐，十五到五十的都有，白刃战能力实在有限，后来崔成焕和老朴决定，干脆教每个人都学会用火枪，连女人也得学。
秦川的本队则成为亲兵队，他给取了个名字叫近卫队（拿破仑的近卫军？），大家都不知道什么是近卫队，由他去了。剩下的二十多杆火枪留给了近卫队，会骑马的十来个军士也被调入，骑乘的马匹是从拉车的马匹中选出来的十来匹还算壮实的马，他们不仅将作为骑兵队，还要充当传令兵和侦骑。秦川把近卫队只分成了骑兵和步兵两个组，他想以后近卫队的所有步兵和骑兵都要配上火枪。
整军完成后，官兵们各归各队，再纷纷换上自己的武器，分有盔甲的则套上盔甲（倭兵的足轻具足的主体构成都是由皮甲，并不沉重，当然稻田的武士具足上铁的成分就有点多了，武士头盔也是铁盔，而不是足轻那种木制的阵笠），原来使用竹枪的，现在全把竹枪扔了，换上倭兵的长矛或倭刀，这次缴获的武器基本上武装了大部分的人，只有后队的人还在使用竹枪。
然后秦川下令，将全部五头拉车的牛都宰杀了，内脏什么的杂碎当场熬汤，合着大米一起熬成混沌汤，给饿了两天的军士百姓充饥，牛肉烤干了作为以后的干粮。骡马毛驴则留下，运载粮草和军需辎重，士兵和百姓每人也要背负十多斤的粮食，伤员和妇孺除外。剩下带不走的粮草辎重和那些大车，统统一把火烧掉。
至于倭寇掠来的财物，他让老朴和崔成焕将金银铜绸等值钱的物件，全部点清后由老朴亲自带人押运，一般衣物则分与那些衣衫单薄的人。粮草辎重大部分都由后队押运，现在后队基本实现了畜力化，除了那二十个护卫组的火枪手，其余的几乎每人都要牵一匹牲口，要么驮着沉重的粮草辎重，要么驮着伤势较重的伤员，另外，老朴还给崔成焕说了尹姓姐弟与秦川的渊源，于是尹姓姐弟也分配了一匹骡子代步，但尹姓女子却把弟弟和另外两个无法走路的孩子弄上骡子，自己跟在骡子后面。
全军匆匆吃完了饭后，秦川又安排把阵亡的二十来个高丽兵士挖个大坑一起