馆内主要呈环形，内院和外院各有专门的灵药区、灵植区、阵法区、擂台区、闭关区，会贤区、救治区，另外，外院有个任务区，内院有个交流协作区和住宅区。
之所以有这两区的区别，便是考虑这个小团伙里，目前大家遇上什么事都能不计酬劳的齐心协力地合作完成，但大家的亲友长辈们未必也能这样，肯定需要一些奖励和报酬。而外院的任务区，便是以贡献度来计量，外院的会员们想要进入内院，必须满足两个条件当中的任意一项。
这两个条件，一是三位黄玉会员的共同批准，而且在馆内任务区的贡献度必须达到一个标准；二，则是所有玛瑙级会员投票后三分之一的人通过，同时得到两大供奉任何一个的同意，同样贡献度要达到标准。
三位黄玉会员死之后，其指定的继承人可自动晋升为黄玉会员；但玛瑙级会员的继承人则必须有至少四位玛瑙级会员的认可才可以袭此会员资格，也就是说，黄玉会员的数量是固定的，玛瑙级会员将来还有可能增加，毕竟王越锋他们目前都还年少，寿命悠长。
贡献度的计算有详细的分类。第一，是看消费的金额。达到一定的标准，便可以以不同的比例来换成贡献度。不过这种方式，赚取的贡献度是最少的，哪怕是一辈子消费，所赚取的贡献度也不可能进入内院。主要是针对那些黑铁会员中财大气粗又与内院没有什么关系的人。
其他的赚取方式，主要是分区来，比如说灵植区，夫子级以下的灵植士想要赚取贡献度，便是在每个月内上交一定数量的灵植，野生的和个人种植的，贡献度略有差别，但并不是无限量上交，有个下限，也有个上限。又或者，是替内院会员处理一些基本的灵植肥液，从中赚取内院会员奖励的贡献度。夫子级以上的灵植士，则是除了上交一定量的灵植之外，每逢七天，在会贤区举办的灵植专场，对低级灵植士遇到的一些疑问进行解答，会后凭着满意度来获得不等的贡献度。
灵药区的贡献度倒是比较容易也简单，就是炼药。只不过上交的灵药因为等级和融合度的不同，贡献度也有所不同，有下限，无上限。允许自带灵植炼药，也可以购买灵植炼药，但每个月从杰馨馆购买的灵植量亦有限制，以免与灵殿的灵植分殿产生利益冲突。
这里比较特别的是闭关区。闭关区的外围有一个过渡感悟区，其中水系和土系区域，内院放的是王越锋自己刻录出来的那张晶片，外院放的则是汪护卫从这张晶片上再复录下来的另两份晶片，效果相对又差了一些，但对于宗师级以下的人却是差不多够了。
这个过渡感悟区，每人每个月最多能在其中待一次，每次限期五天。五天过后，会有传送的力量强制将其传送出来。而这个过渡感悟区，每一个新进的外院会员，夫子级以上的灵士，第一次都可以使用金钱来体验一天，修为不同，所花的金钱也不等。而一天之后，必须用贡献度。