英军一撤走，兰芳共和国政府就在林飞的授意下对城中的荷兰人和土著人进行了清算，华人政府没收了荷兰富商和高官的财产，接收了荷兰富商的工厂，准许荷兰人离开坤甸，不少荷兰富商离开了坤甸，也有不少荷兰平民加入了兰芳共和国国籍。
荷军士兵和警察则被关进了战俘营，充当苦力，林飞打算大举开发婆罗洲，劳动力多多益善。
至于土著人，凡是参与过杀人、抢劫和qiáng_jiān的，为首者一律枪决，从众一律进入战俘营，和荷军士兵一样充当苦力。
“秋后算账”进行了半个月，到3月1日的时候，所有事情都处理完毕，林飞终于空闲下来，吩咐部下：“刘紫瑜姑娘不是一直想要见我吗？让她来吧。”
原来在这之前，刘紫瑜数次求见林飞，要求参与到各项事务中去，林飞一直都对刘紫瑜心有怀疑，所以只让刘紫瑜在天龙舰上待着，什么事情都不让她做。
刘紫瑜见到了林飞，没有半点好脸色，她气冲冲地说道：“陛下，您什么都不让我做？这算什么？软禁我吗？”
林飞当然不能说自己对她有怀疑，于是笑道：“我看你是一个温温柔柔的女孩子，所以没让你去做各种工作。”
刘紫瑜不满地说道：“女孩子怎么了？凌雪不是女孩子吗？你为什么让她负责工业部的工作？玉凝霜不是女孩子吗？在台湾的时候你为什么让她打了那么多场仗？”
林飞无言以对，只好安慰道：“等回了大禹城，我一定给你很重要的工作。”刘紫瑜的怒火这才稍微减弱，林飞又请刘紫瑜吃晚饭，在吃饭的时候，林飞用聊家常的方式把刘紫瑜的家人住处问了个清楚，然后吩咐手下特工谢明峰，悄悄潜入苏门答腊，调查这些事情。
林飞把刘紫瑜的事情安排妥当，开始安排开发婆罗洲的事情，婆罗洲很大，名义上都是荷兰的殖民地，不过在这个时代，除了坤甸开发得比较早，荷兰人比较多以外，其他地方的人都是未开化的土著野人，所以占据了坤甸，基本上就相当于占据了荷兰人的婆罗洲。
林飞授意兰芳共和国宣布：“整个婆罗洲，除了沙捞越、文莱和沙巴为英国领土之外，都是兰芳共和国领土。”
这个消息一经宣布，荷兰王国立刻站出来提出了严正抗议，不过林飞授意兰芳共和国置之不理，这件事情也没有引起太大争端，荷兰人虽然恨兰芳共和国入骨，可是他们实在没有实力发动一次登陆作战，夺回坤甸。
婆罗洲最吸引林飞的就是石油资源，在他的时代，拥有婆罗洲的印度尼西亚是世界上最重要的石油输出国之一，婆罗洲的南部有几座特大型油田，这些油田的石油品质好，储藏位置浅，很容易开采。
林飞虽然在棉兰老岛的苏里高地区发现了石油，不过那里的石油储量极低，除了做燃烧罐和云爆弹，无法供给大规模工业应用，现在婆罗洲的石油可以大规模应用在工业上，有了石油就可以炼制柴油和汽油，到时候林飞就能有自己的内燃机了。
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