后勤保障组负责做好后勤保障工作，确保医药用品等各种物资和设备不断档、不涨价。农村组负责把农村疫情的防治工作做在前面，摸清农村疫情，采取相应防治措施，对困难患者实行免费治疗，对城市农民工就地救治。
外事组负责加强国际合作，加强与世界卫生组织的合作，加强与香港、澳门特别行政区和台湾地区的合作。
宣传组负责大力宣传党中央和国务院的正确决策，宣传传染病防治法与防治知识，宣传防治工作中的先进人物和先进事迹，树立群众的信心;社会治安组负责加强社会治安综合治理，坚决打击趁机造谣惑众、哄抬物价等各种违法犯罪活动，维护群众利益。
教育组负责加强学校的疫情防治工作，充分发挥党、团组织和教师的作用，关心师生身体健康，对患病学生要及时救治，维护学校的正常秩序。北京组负责北京市**的防治工作，并将其作为全国的重中之重，抓紧抓好。
寒雨病毒与疾病研究中心为重要合作单位，负责病毒疫苗的研制。由于这项工作进行的早，在一月份的时候就已经开始着手进行，而进展也非常顺利。在全国开始大范围的爆发疫情的时候，这项工作已经进入了攻坚阶段。
四月三日，寒雨病毒与疾病研究中心宣布，成功研制出疫苗。从这一刻起，全面控制疫情以及最终消灭疫情有了最有力的保障。
随即，全国各大医疗机构开始大量培植疫苗，疫情很快得到了全面控制。
从一月份开始，全国累计报告诊断病例四千五百零七例(其中医务人员八百五十九例)，死亡一百零三例。
四月十二日，全国首次出现无新发病例报告，此后再无新增病例。四月二十三日，世界卫生组织将广东从“近期有当地传播”的名单上删除，标志着广东防控**疫情取得了重大胜利。四月二十九日，世界卫生组织宣布解除对北京的旅行警告，并从“近期有当地传播”的名单上删除，标志着北京和全国防治**的斗争已经取得了阶段xing胜利。
五月十六日，卫生部副部长朱庆生在北京地坛医院宣布，地坛医院的最后一批**患者康复出院，这也是全北京市和全国在院的最后一批**患者。
朱庆生称，最后一批**康复患者出院标志着首都防治**的医疗救治任务已经全面完成。
朱庆生同时提醒，首都防治**工作仍要严阵以待。朱庆生说，“今天地坛医院将开始恢复正常的医疗工作秩序，接诊和收治其他传染病患者。但是，为了保证完成今冬明春防止**出现反复的重大任务，你们还要严阵以待。做好充分准备，只要一有**疫情，启动了三极预警，就要立即启用地坛医院，接到指挥部的命令后，二十四小时内就要人员全部到位，完成各项准备工作，具备接收患者的条件。”