由于各种各样的原因，这个大的反对轴心国的联盟仍然缺乏军事协作。到了12月16日，英国仍然不能集合增援部队阻止日军在婆罗洲北岸沙捞越登陆，只有旁遮普步兵中“可以拼掉的一个营”进行了两个星期的游击抵抗，摧毁了油井设施。荷兰海军的潜艇击沉了两艘日本运兵船，击伤了一艘驱逐舰，但是他们的努力并不比美国亚洲舰队在阻止日军攻占吕宋岛东南部时所作的努力更成功。“旗鱼”号是唯一击中目标的一艘舰艇，它在关岛附近击沉了一艘运兵船，美国亚洲舰队的其他战舰，包括老式航空母舰“兰利”号，向南撤退到比较安全的爪哇海。旗舰“休斯顿”号巡洋舰撤到婆罗洲东海岸的巴厘巴板，哈特在致麦克阿瑟的一份令人沮丧的备忘录中说，他之所以撤走大部分人员和剩下的海军水上飞机，是因为“日本空军在吕宋岛上空取得了胜利”。美国海军的明显逃跑行为，造成了日后海军将领与麦克阿瑟之间的深刻分歧，麦克阿瑟在向华盛顿报告时特别提到了这种分歧。然而尽管如此，美国参谋长联席会议还是认可了哈特的行动，他们一致认为，目前留在菲律宾的65架海军战斗机是不能阻止一场大规模入侵的。
尽管麦克阿瑟一再要求增援，马歇尔还是认为，增援部队不可能通过日本的海上封锁线，因此他命令横渡太平洋把军队和飞机运往马尼拉的护航舰队改变航向，开往澳大利亚。麦克阿瑟提出抗议，他强调了菲律宾的“战略重要性”，呼吁民主国家集中一切力量，将增援部队运到目的地。然而，到了12月12日，他也不得不承认“敌人的空军力量占有压倒的优势”，只好允许布里尔顿将军将剩下的“b-17”轰炸机和大部分幸存的战斗机撤到澳大利亚北部海岸的达尔文港。
马歇尔和陆军部长史汀生还不完全承认他们必须放弃菲律宾群岛。这是陆军首脑向德怀特？艾森豪威尔提出的第一个问题。珍珠港事件发生之后一个星期，艾森豪威尔担任了战争计划委员会主任这一美军中极其重要的职务，他意识到马歇尔希望他同意“我们不能放弃菲律宾”这个观点。尽管他在马尼拉当过三年麦克阿瑟的副手，同麦克阿瑟有私人交情，但他还是清醒地估计到：增援部队要几个月才能到达菲律宾。他警告说：“如果敌人大举进攻，那么在少量援助下，可能守不住几个月。”
“尽你们最大努力挽救他们，”马歇尔还是发出了命令，他知道，海军受到了很大的压力，既要援救威克岛，又要守卫夏威夷和美国的西海岸，守住菲律宾的可能性就极其微小。在马尼拉，麦克阿瑟责备哈特海军上将没有作出更多的努力，但他不能指责他没有搞到迫切需要的飞机。装有这些飞机部件的板条箱到达布里斯班时，打开板条箱一看，发现飞机的引擎缺乏必不可少的螺线管，美国航运公司的办事员所犯的这个疏忽错误，使史汀生暴跳如雷。但好在事情很快有了转机，一支从西贡出发的中国船队很快到达了菲律宾，将第一批150架p1m“云雀”式战斗机交到了美军手中，这里面有50架是给英军的，这批飞机的到来使菲律宾美军的防空能力大大的加强，在某种程度上加强了美军的信心。
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