石遵继皇帝位后，大赦天下死刑以外的罪犯以安抚人心，逃亡乞活军领地上白的李农前来归附谢罪，石遵将其官复原职。石宣的东宫卫士“高力督”梁犊却没有跟着李农一道归顺，仍然与飞龙卫一道留在广宗做乞活军。石遵以石闵与乞活军有牵连为借口毁掉立他为太子的承诺，改立燕王石斌的儿子石衍为太子。石闵被封武兴公、辅国大将军，太尉督中外诸军事，并录尚书事辅佐朝政。石闵平静地接受了石遵的圣旨，入朝奏事一如往常。
史官司马喜记载：石遵即位第七日，狂风拔起树木，雷声大作，天降冰雹，大如盂钵。太武殿、晖华殿失火，诸门观阁荡然无存，其中乘舆服饰及御用物大半被烧，火焰冲天，钟鼎乐器等都化为灰烬，大火燃烧了一个多月才熄灭。或曰，其幼弟石世冤魂作祟于邺宫。
石遵废杀幼帝自立的消息传到镇守蓟城的沛王石冲那里。石冲年纪教石斌和石遵都大，其母是地位卑贱的美人，石冲因此不得石虎宠爱，但却处处不甘人后，好出风头博宠。石冲认为石世是秉承先帝旨意即位，石遵专横地废除自己兄弟还背信杀掉，与石邃石宣的逆行无异，点起五万兵马南下。檄送到邺城后，石遵遣石闵与李农率十万人马讨伐。双方在平棘交手，石冲毫无悬念地惨败，还被石闵生擒，所率五万军士剩下的三万都做了飞龙军均俘虏。
不久，石遵处置自己兄长的皇命下达，赐石冲自尽，命石闵、李农将其三万被俘的士卒全部活埋。石冲自刎后，监刑士卒割下人头呈给石闵，这是要带回邺都向石遵复命的。李农命人收好石冲人头后，遣散众人招呼石闵一同煮茶小憩，等待活埋任务执行完毕。活埋三万人，确需费上几日时间。
李农往茶壶里撒下一把糖和盐搅匀，给自己和石闵各舀了一碗，然后心满意足地大口喝完。石闵只小尝一口便皱眉倒掉，他在未央书院修学期间，每日阿拉耶识都会亲手演示茶艺，泡清茶给众弟子尝，早已不习惯如此浓烈味重的喝法。
“咋了？糟蹋东西。”李农美滋滋地端上茶碗喝了一口后又放下，饶有趣味地盯着这位老友之子，“这么心浮气躁，感情又在想天巫了？”
石闵被他说中心事，嘴上却否认道：“石冲的人头睁着眼睛，我在想石宣、石韬和石世恐怕都死不瞑目。”
李农哼哼两声，苦笑地看着对方道：“我以为你在想我俩出征的事……”
石闵与他四目交接却没吭声，李农只得继续往下说：“你小子别跟我揣着明白装糊涂。朝中重臣中，除了你我二人其余皆是胡人。看着交给我们一支十万人大军讨伐石冲，实则消耗我们华夏武将的实力，战胜了连降卒都不让我们收编，分明不相信你我，变相削权！”
“我对权力不感兴趣。”石闵对李农的话没什么反应。
“呵呵，难怪太子之位与你无缘。”李农不甘心，打算挑战石闵最敏感所在，“没有权力，你还保得住天巫？”
石闵犀利的双眸直刺李农，锐声道：“你错了，非我保护天巫，自始至终，都是她在保全我。”
李农嘿嘿干笑，“你这么说也不错。”
石闵低下头拨弄炭火，淡淡道：“听说你在广宗境遇才真的不错，乞活军对你多有仰仗。似你这般二进二出，陛下难免有些顾虑。”
“二进二出”乃是指李农在乞活军和羯人两者之间做墙头草，这是李农被羯人猜忌的根本。石闵的话戳中痛处，李农也沉默了。两人各怀心事，埋头喝闷茶，任外面被活埋士兵凄厉嚎叫也划不破军帐中死寂的气息。
回到邺城后，石闵lùn_gōng行赏，安抚殿中将士和原石宣东宫的高力一万人，把他们都升为殿中员外将军进爵为关外侯，还赐给了宫女为配偶。军士们得到安抚和奖赏后，人人称颂军神石闵恩德。中书令孟淮和左卫将军王鸾向石遵挑拨，说石闵居功自傲，奖赏军士树个人私恩，全然没将皇上放在眼里，有欺主之嫌。石闵功高震主本就是石遵心病，被孟淮王鸾撩拨后便将石闵给受封将士的封号题名加以变更，还把对他们的褒贬评价都做了改动，以此来显示皇威，压制石闵势力。石遵没想到的是，军士心目中来自军神石闵的评价比一个靠吃老子老本得了皇位的皇帝更加受尊重，他胡乱批改的题名和评价让将士怨气重重，好事变坏事。
徐统此时仍旧担当侍中职务，暗中相助石闵。他探听到孟淮、王鸾等人谗毁石闵骄纵，劝石遵削夺他兵权，悄悄告诉石闵后，石闵竟然没有诧异，淡淡恬静的神情和当初寄居自己家中的天巫出奇相似，令徐统啧啧称奇。
石遵承诺石闵封皇太子，找寻天巫一样都没有兑现。实际上，石遵最忌惮的便是天巫相助石闵，且不说石闵兵权在握，只要天巫出来捧石闵为天命之人，石家的江山便岌岌可危。石遵迫不及待地召义阳王石鉴和乐平王石苞、汝阴王石琨、淮南王石昭等自家兄弟人入宫，来到太后郑樱桃面前进行商议。
石遵说：“石闵不忠于君主的迹象已逐渐明显，如今我想把他杀掉，怎么样？”
石鉴等人都附和说应当如此，只有太后郑樱桃反对，这位郑太后是前太子石邃和石遵的生母，深知石虎的儿子们冲动行事的后果，劝说他们道：“当初在李城起兵时，如果没有石闵岂能有今天？现在各地王爷们一盘散沙，各有打算，杀了石闵谁