永禄元年，八月二十九日。幕府权臣伊势伊势守贞孝于中尾城举兵谋反。六角、高屋田山两家大名也先后举兵响应。征夷大将军足利义辉则是在谦信的护送下来到坂本城避难。
不过，世人都认为亲三好家的伊势贞孝这次却没有得到‘天下人’三好长庆的支持。作为京畿一带最大的势力，三好家的一举一动完全能左右这场蓄谋已久的举兵。可是三好长庆却出人意料的选择了在芥川山城内开着茶会，对着和歌。
三好长庆的举动虽然让谦信有些疑惑，但是也不能完全认为三好家就是自己的盟友。况且她此次上洛就是一方面为了能获得讨伐武田家的御教书，另一方面则是要杀杀三好家的锐气。
由于足利义辉本人的突然失踪，大部分的奉公众武士们都选择了中立和保持沉默。他们都不知道足利义辉在哪里，也不能盲目的加入叛军的行列。足利义辉自然不是独自一人进入坂本城。与他一道进入坂本城的还有他的侧近进士晴舍、治部藤通、治部藤阿弥、一色淡路守、仁木七郎五人。
伊势贞孝的中尾城石高虽然为两万石，不过京畿一带人口众多，他却能凭借着这个征召出五千军势。若是加上六角义贤和畠山高政两部就要过两万余了。河内田山家拥有纪伊、河内两国守护职，若是事态紧急还能招募根来众和杂贺众参战。万幸的是畠山高政并没有去招募根来众和杂贺众，他认为有六角和河内田山两家所动员出近两万的兵力还会打不赢西近江不满三万石领地的明智光秀？然而明智光秀招安的坚田众可就不是什么善类了。这一点六角义贤和畠山高政都不知道，就连长期在京都处理政事的伊势贞孝都没有正眼看过坚田众。所以说，明智光秀手里还是有坚田众这一张王牌的。
万幸的是，浅井家并没有乘机对明智光秀落井下石。浅井长政很清楚国人众的力量，而浅井家本身就是一个国人众联盟。他倒是决定不去落井下石，毕竟自己对六角家的蚕食最好是要在六角家损失惨重后进行，而明智光秀就正好成为了自己成就近江一番霸业的垫脚石。浅井长政的想法还是很美好的，当然他不动手的原因也在于织田家方面。毕竟织田家和上杉家也有过联姻，时任镇守府将军的藤原朝定就娶了织田犬为侧室。浅井家内部也有相当一部分家臣希望借此一窥上杉家在京都方面的实力究竟如何。
既然伊势贞孝正大光明的反了，谦信也不能坐视不管。她本人既然在京都就不能放任这些乱臣贼子为所欲为。为了让幕府方的实力不受到损失，谦信并不打算让足利义辉去下令奉公众协助自己，而是打算以明智光秀部单独出战对抗三家联军。而谦信也有很大的信心去迎击数倍于己的敌军，她毫无畏惧。
就当叛军们在积极地朝着京都进军的同时，明智光秀将京都周边淀川的水运众淀川众调略为己方。并且以他们暂时替代坚田众在陆地的作战任务。这样坚田众就能抽出身来利用在琵琶湖内畅通无阻的能力驶着大量的小早和几艘关船对六角家沿琵琶湖一带领地持续袭扰。而淀川众首领淀川三右卫门则是被谦信直接调拨给明智光秀当与力，自己不直接管辖。
这次，明智光秀利用自己在京都这些年建立的关系网终于发挥了作用。他将之前投奔自己的明智家武士组建起了一支上百人的武士队来提升己方的战力。不仅如此，他还将丹波国内的国人领主拉拢到己方，如头巾山周边的领主川胜家、小畠家。他们两家就带着本部兵马合计一千余火速赶至坂本城参阵。
有了丹波国人领主的参阵后，谦信手头上的可用之兵就达到了六千四百余（坚田众一千余势、川胜家与小畠家一千余势、淀川众两百余势、坂本与今坚田征召军势四千余、明智武士队一百余、铁炮足轻队一百人）
八月三十一日，六角军的先阵为南近江的旗头山冈景之，其部九百余率先出阵并且准备抢占滋贺郡的膳所城。不过，谦信已经猜到了六角军的目标。她令明智扫部（坚田众，被赐予明智苗字）、明智九太夫、明智市尉三人率三百军势火速抢占了膳所城并且固守。
而六角军或者膳所城被明智军抢占后立即开始了对膳所城的攻击。青地城的马渊冬纲、三云城的三运定持等六角家臣先后率部赶至膳所城下。瞬间围城的六角军就达到了三千余，是城内守军的三倍。而城内的三名明智家家臣并不担心，就算敌军的数量十倍于己，他们仅仅需要守住城池两天即可，剩下的就是反击了。由于城内的防守甚为严密，以至于六角家的甲贺众无法潜入城内进行破坏和偷开城门。
明智光秀一开始就被谦信留在坂本城用来调度各部军势，而谦信自己则是率明智光秀组建好的武士队和铁炮足轻队利用坚田众的运输能力投送到六角家的腹地——蒲生郡。
谦信以两百的兵力就敢去六角家的腹地也是得知了永原城的永原重兴曾经得到足利义辉的赏赐，他是不会与六角家同流合污。而他的领地就是谦信的突破口。谦信在事先和永原重兴交涉后就在经过永原领时火速换上六角家的旗指物——鹤之丸，以防被甲贺众、伊贺众发现。
九月一日，在这一天的傍晚，谦信终于等到了朝着膳所城进军的六角军。就当东近江的六角军集结起来向西近江进军时在长光寺遭到了谦信的伏击。山崎宗家、高野濑秀隆等三千