当夜赵昺又召见了赵孟锦和刘洙、黄显耀、刘志学三人。首先就江璆‘出走’一事征求了他们的看法，他们以为江璆虽无可能背叛帅府，但其擅自调军有插手军务的嫌疑和拉拢后军的迹象。
因为后军皆是由朝廷拨给的义勇组成，当时为了加强他们的战斗力，将大部殿前禁军调入其部充任中、低级军官，所以是帅府对其控制力最弱的一部。而江璆曾统军多年，又曾带领义勇在广东与敌作战，十分了解他们的需求和心理；加上殿前禁军基本上都是江氏子弟兵组成，其会十分容易将后军收为己用。
赵昺知道军队是自己立足这个世界的根本，因此必须掌握在自己的手中，不论什么原因都不能将军权拱手让人，而江璆此举不论是否有插手军务的企图都触及了他的逆鳞，是他不能容忍的。既然自己的几位心腹爱将都由此看法，那就必须采取措施以防不测，绝不能让江璆将后军变为江家军，并将后军重新置于自己的麾下。
原本赵昺是准备将中军和前军置于琼州，作为防御海峡的主要力量；左、右军分置昌化和万安两军，作为两翼，随时增援琼州；而将战斗力最弱的后军放在最南边的吉阳军，作为维护岛内稳定的主要力量，同时充当预备队。如今这种情况下，他当下做出了调整，将后军置于琼州，放在自己的眼皮底下，而前军则驻扎在吉阳军。
而赵昺起先是想将从广州带来的各路义勇集中编入各军，但现在也不得不做出微调。他计划将摧锋军和勇敢军编为新军，不足之数自各军拨调，保留摧锋军军号，由帅府直接管辖。九江降兵则尽数编入水军。陈氏兄弟所领义军编为五个指挥分别拨入各军，而江璆所招募的义军则分散编入各军补充原有的缺额。
对于整军赵孟锦等人都表示同意。因为帅府军接连扩军，原本的护军已经成为了少数，若再不整训将有被其它各部吞并之虞。正可借助整军的机会，加强老班底的实力和影响力，从而增强统御力。而现在各军居无定所，修筑军营和防御设施是当务之急，整训又势在必行，成为一个不可调和的矛盾。
赵孟锦提出先可将各军教头统一编为一队由都统司直隶负责教战，然后再行抽调各级军官入营轮番进行整训，待教导完毕回营后再教授士兵，从而达到以一教十提高整体战斗力的目的。刘洙又提出可以区别不同兵种一一编队，分别教战，这样既可以加快整训速度，又能加强专业训练，以保证训练效果。
赵昺深以为是，其他几位也十分赞同。于是他命各人回去后立刻将想法写成条陈，报送抚司，自己在从中周旋以尽快促成此事，如此一来江璆即便想反对他也鞭长莫及，而等他回来木已成舟想改变也无力达成。这样就削弱了江家在帅府军的影响力，而其想插手军务也不能够，却进一步确定了赵昺统帅的地位。
赵孟锦等人清楚只有保证殿下在帅府的权威，他们才能在现今‘敌’强我弱的情形下站稳脚跟，保住自己的地位，利益的一致性让他们对殿下的话当然言听计从。而赵昺通过整军不但加强了对各军的控制力，且提高了帅府军的战斗力，进而让自己能在这乱世之中守住一方净土，求得一条生路……
接下来两天，赵昺又召见了庄世林和郝云通、周翔等属官，密会了应节严等人。而得知江璆率军‘出走’之事已过去三天了，帅府派出寻找的人还没有传回消息。情况不明，众官也对此事都保持沉默，也没有人公开议论此事，使得事件仿佛成了禁忌一般。
但帅府军上岛后要处理的事情很多，不可能一直等下去，要尽快对几件大事做出安排。于是在到琼的第三日，赵昺聚将议事。参会者除帅府各司主官及案首外和军中统制以上将领外，琼州所辖州县首官及属官皆列席参会。首先由各司和琼州主官讲了当前形势，介绍了情况，并提出需要解决的问题。
按照惯例下一步该由众人商议，拿出意见，由殿下做出决断。可殿下却一反常规，而是对人事进行了安排，宣布由抚帅应节严主持帅府工作，主管琼州军政事务；鉴于江璆擅自离岛，转运司由副使潘安主事，陈则翁为转运司判官协理工作，待江璆归来查明情况后另行处置。同时免去赵与珞路管转运使之职，琼州知州不变，兼任军前转运使；提刑司和常平司两位主官不变。
接着任命王府侍读、帅府记室邓光荐为琼州廉访使，负责监察帅府及各州县官员，同时督查军纪，整肃不法；任命赵孟锦为琼州兵马使，统管琼州所属各路兵马，同时仍兼任本职；任命刘洙为沿海防御使，统管各路水军，设置水寨御敌；任命陈任翁为摧锋军统制，负责整编摧锋军和勇敢军。
原摧锋军统制马发为琼州招讨使，负责平定地方不法，清剿海贼；帅府都作院主事周翔兼任琼州都作监寺监，负责一应军械的修造及建造军营、堡寨。其后命令各军准备开拔，前往驻地，相应计划由抚司和都统司商定。
而琼州各州县官员暂时各安其职，听候调遣，待帅府考官后再做定夺，要求各州县举荐贤才以为朝廷所用。同时给百姓解释清楚，帅府军来琼是为抗击蒙古人的入侵，告知不必慌张。万不可借机巧立名目收取捐税，骚扰百姓。再有各州县要尽快整理好相应公文、账册，整理好仓廪，以备各有司查检。
随着殿下清朗的童音，堂上有