职掌内外武职官员的除授、封荫之典，乘载、邮传之制，甄核、简练之方，士籍、军实之数。
兵部下设四司﹕武选清吏司，考核武职官员的品级与选补、升调、承袭、封赠诸事，并管理土司。
车驾清吏司，掌全国马政及驿传等事；职方清吏司，掌武职官员的叙功、核过、抚恤、军旅之简阅、考察、巡防等事，并管理关禁与海禁。
武库清吏司，掌全国之兵籍、军器并武科考试之事。此外，清设稽俸厅，掌稽察武职官俸。
会同馆，管理京师驿传事务。捷报处，掌递送文书。类似今天的国防部，中央军委及其各军事机关。
刑部。
为主管全国刑罚政令及审核刑名的机构，与督察院管稽察、大理寺掌重大案件的最后审理和复核，共为“三法司制”。
类似现在的司法部和公检法部门。
工部。
为管理全国工程事务的机关。职掌土木兴建之制，器物利用之式，渠堰疏降之法，陵寝供亿之典。凡全国之土木、水利工程，机器制造工程，矿冶、纺织等官办工业无不综理，并主管一部分金融货币和统一度量衡。
类似现在的工信部、水利部、城乡建设部。
而至于新设的民部，则管着民生大计。
说白了就是调查现在民间的一切七杂八杂的事物，并从中筛选出最应该解决的事物，交由六部解决。
谁家要打官司，谁家要建房，谁家死了人……都和民部有关系。
一个专门为了服务平民而出现的部门，与现代的所有部门都有关系。