为了使大家更好的理解本文，在这里我将本书主线年代表放出，在不大量剧透的前提下告诉大家一些重要的时间点，另外本书篇幅的一小半是九代巫女到十二代巫女这段时期的剧情，一大半是灵梦这代的剧情，里面会有些让人意想不到的人物出现，比如冴月麟，剧情中把俗称黑历史的前五作和正作联系起来，现在放出本书的年代表：
1469年7月希萨莉出生
1481年5月妮娜侵入希萨莉梦境并被击退
1484年12月切尔弗家族覆灭，希萨莉逃亡并被希里亚所救。（本书的开端）
1498年3月希萨莉成为魔女。
1820年2月已经成为仙人的初代博丽巫女协助紫开启博丽大结界，最后以自己为祭品成功开启了大结界。
1820年3月~1837年5月这十七年间，先后六代博丽巫女由于没能与大结界完美契合因此只能发挥出高级妖怪的实力，而发动异变的往往是拥有大妖怪的实力，因此这六代巫女们先后阵亡，紫虽然也是维护幻想乡平衡的，但其本身毕竟是妖怪，每次都是因为稍有犹豫从而造成了巫女的死亡。
1837年6月第八代博丽巫女继任，紫为了不让之前的悲剧重演，尽最大的努力帮助这位巫女。
1868年12月第八代博丽巫女去世，紫发现是因为结界的力量太过庞大导致巫女接受力量后只能活三十年左右。
1869年1月博丽蝶梦继任第九代博丽巫女。
1871年3月希萨莉进入幻想乡（本书中描述幻想乡的故事的开端）
1902年5月博丽蝶梦去世，死时将自己的一切化为万千蝴蝶融入幻想乡中，以此来和自己深爱的幻想乡融为一体。
1902年6月博丽月梦继任。
1935年12月博丽月梦去世，虽然她的天赋使其保持不老但终究无法打破博丽巫女继任三十年左右死去的魔咒，由于她未曾设定新一任巫女，八云紫用她的结界的力量补充博丽大结界的力量并维持了十多年。
1945年六十年一次的花之异变爆发。
1950年1月博丽天梦继任巫女之位。
1966年2月博丽天梦失踪，八云紫猜测她可能是感受到自己已经活不长了，准备一个人安静的离去。
1966年3月新的巫女继任，她自称是被天梦选中的人，别人问她前代巫女去哪了，她闭口不说，为了全心全意地履行义务，这位巫女连姓名都舍弃了，别人问她名字时她就说自己是第十二代博丽巫女。
1967年4月希萨莉发现新的巫女对幻想乡平衡的理解非常偏颇，巫女认为要想维持平衡就必须把人类和妖怪彻底隔开，于是希萨莉开始着手准备以便巫女真正开始驱逐妖怪时应对。
1969年6月第十二代巫女带领人类除妖师开始以维护幻想乡人类妖怪的平衡为名想把妖怪驱逐到幻想乡另一边，由于希萨莉事先的准备，巫女没能得逞，双方陷入僵持，紫因为某些原因不愿意出手。
1978年7月在希萨莉的开导下，第十二代巫女放弃了对妖怪盲目的镇压，开始试着和妖怪交朋友。
1980年8月灵梦出生，由于被父母遗弃，第十二代巫女收养了她并将其定为巫女继承人。
1996年10月第十二代巫女去世，并嘱托希萨莉在灵梦没有强大的实力前保护灵梦。
1996年11月，灵梦接受博丽的力量成为第十三代博丽巫女，为了解决鬼怪和魔族对人类的威胁独自前往地狱和魔界，由于担心灵梦的安全，希萨莉带着芙丝特暗中跟随，在关键时刻出现阻止萨丽艾尔对灵梦出手。
1997年8月，蕾米莉亚·斯卡雷特进入幻想乡，希萨莉感觉到幻想乡的传送门中有熟悉的气息传来但因为在魔界的缘故最终没有什么发现。
同月，灵梦从魔界回来时发现神社被妖魔鬼怪侵入，与魔梨沙，魅魔等交战，两位后来解决异变最积极的人第一次相遇。
1997年12月神社旁出现了相传可以给人带来幸福的遗迹，冈崎梦美从现世到了幻想乡并发生了一系列争端，希萨莉对外界的科技产生了好奇，找到梦美进行了讨论。
1998年8月梦幻馆散发出强大的魔法能量，博丽神社被恶灵包围，灵梦找到了异变的源头——梦幻馆，魔梨沙为了占据这份力量也出发了。
1998年12月魔界再次发生异变，灵梦再次前往魔界，魔梨沙，魅魔，幽香也怀着各自的目的前往这魔法圣地。因为上次的教训，希萨莉也陪同一起前往。
1999年3月，魔界的异变解决了，但最后魔法能量的暴动和一切的扭曲给灵梦和魔梨沙带来了灭顶之灾，最后灵梦在希萨莉的帮助下将自身的伤势固化才活了下来，但相貌却一直保持在16岁，紫发变成了黑发，性格也产生了较大的变化，给人感觉除了有异变其他时候懒洋洋的而且贪财。魔梨沙没有幸免，在神绮的帮助下成功转生，但一切的扭曲使其转生在了十二年前的外界。幽香回来后性格也产生了一定的变化，对待敌人没有以前那么残暴了，但同时多出了很多恶趣味，落在她手里依旧凶多吉少，梦幻馆似乎她也不经常回去了，大多数时间都在太阳花田旁，魅魔在这次事件后不知所踪，爱丽丝之前在希萨莉的开导下想和打败自己的魔梨沙交朋友，好不容易赶到魔梨沙那却正好看到对方惨死的一幕，因为这件事她始终无法释怀，最终独自前往幻想乡历练，神绮也因此自责不已。
2001年3月魔梨沙的转世魔理沙因为会魔法的