桓玄此举乃是为了安抚京师内各个世家大族，因为王谧、羊孚、刘迈等人几乎代表了目前京师中各个派系。
而各个门阀士族其实也愿意看到桓玄驱除司马道子父子专权，恢复司马氏与各个门阀之间共治的局面。
但显然他们都小觑了桓玄，如今桓玄只是初来乍到，不敢将野心暴露出来，才不得不伪装成一幅礼贤下士的样子。
其实在桓玄内心，他早巴不得马上取代晋室，篡权上位。
但不管怎么说，至少到目前为止，桓玄做得十分出色，赢得了朝野内外一致称赞。
连后世史书都称，桓玄初入京师时，斥去奸佞，提拔贤才，京师上下都十分高兴，都希望他能结束当前混乱局面。
得志后的桓玄动作迅速，立即对司马道子父子一党展开清算。
数日后，也就是在桓玄进入京师的第四天，有人举报会稽王司马道子酗酒、不孝，按照法律，应当被斩首。
随后天子下诏，将司马道子流放到新安郡，并斩杀司马元显以及包括世子东海王司马彦璋在内的六个儿子。
除此之外，谯王司马尚之、张法顺、太傅从事中郎毛泰及其弟弟游击将军毛邃、太傅参军荀逊、吏部郎袁遵等会稽王同党悉数被杀。
司马尚之二弟、丹阳尹司马恢之，三弟、辅国将军司马允之，毛泰的四弟、太傅主簿毛遁等人则被流放广州。
原朝廷重臣中，除了王珣、车胤、谢靖、王珣等人因病或其他原因侥幸逃过一劫外，大部分人都被桓玄问罪，或罢官去职，或流放外地。
即使将司马道子流放外地，桓玄依然无法完全放心。
为了永绝后患，桓玄派人将司马道子、司马恢之、司马允之等人诛杀在流放途中。
原本桓玄还要诛杀王诞，却被桓修等人苦苦求情，又说出王诞曾求情的经过，他这才赦免了王诞，只是将其流放广州了事。
桓玄在流放了会稽王后，又将其诛杀，可谓狠毒。
而朝野内外看到桓玄大肆株连，顿时人人自危，连刚刚被罢免了司徒职位的琅琊王也是惶恐不安。
只不过如今桓玄掌权，他再也不能随意出入宫中，无法向刘穆之讨教对策。
可他哪里知道，当桓玄入主京师后，刘穆之早将琅琊王抛之脑后，如今正一门心思地要帮河西弄到出征益州的大义。