那时的孝宗已没了早年锐意恢复的精神，对这一番刺耳的忠言，也无可奈何，说自己的眼病很重，谁能担当此任，你就同他说去吧。叶正则再欲进言，孝宗惨然一笑，好久说不出话来。
光宗即位后，叶正则外任湖北安抚司参议，临别前作奏札上报，直言国家有六不善，即：国势不振，人才不多，民众不富，兵力不强，财赋不足，法制不够完善。又说：“首先，倘若不确立治国之宗旨，让这六个方面本末损坏，如同一棵大树，内有蠹虫，再不快速根治，任其下去，枝干将逐渐枯萎，支离涣散，到那时候，我再怎么说也无济于事了。”
可是，朝廷仍然毫无反应。